Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms