Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms