Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPKQ9BS16 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPKQ9BS16 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms