Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms