Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms