Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms