Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms