Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYCBPQ99417 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms