Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRAMP1Q96RY5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms