Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP4Q96PP9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms