Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC34Q96HJ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms