Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RNF185Q96GF1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RNF185Q96GF1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RNF185Q96GF1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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