Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCMH1Q96GD3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms