Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM4SF18Q96CE8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms