Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTSSAQ969W0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms