Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM54Q969K7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms