Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms