Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms