Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms