Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms