Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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DTX3Q8N9I9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX3Q8N9I9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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