Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVOPQ8N4V2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms