Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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