Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP2Q8IXW5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms