Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms