Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3BQ7Z3V4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3BQ7Z3V4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms