Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATG9AQ7Z3C6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms