Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms