Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms