Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBR1LQ6UX01 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms