Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms