Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC41PQ6P2S7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms