Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms