Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSL3PQ5NE16 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms