Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms