Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC178Q5BJE1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms