Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms