Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms