Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LONRF3Q496Y0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms