Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms