Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CCDC96Q2M329 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CCDC96Q2M329 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC96Q2M329 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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