Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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