Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK4Q16654 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms