Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms