Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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