Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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