Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRR4Q16378 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms