Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms