Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.728e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 ARNT-206ENST00000497108 546 ntTSL 49.96□□□□□ -0.828e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 ARNT-207ENST00000504358 571 ntTSL 49.32□□□□□ -0.928e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 ARNT-209ENST00000505979 570 ntTSL 28.53□□□□□ -1.048e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-211ENST00000494347 712 ntTSL 26.87□□□□□ -1.319e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.389e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-206ENST00000461645 743 ntTSL 24.11□□□□□ -1.759e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.27e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.047e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.097e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.147e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.197e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.327e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.47e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.497e-11■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.187e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.387e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-13■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 TAGLN2-205ENST00000478033 1051 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-13■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.161e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SLC43A3-205ENST00000525205 862 ntTSL 311.75□□□□□ -0.531e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 LARP1-205ENST00000518595 773 ntTSL 27.58□□□□□ -1.28e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 LARP1-207ENST00000518742 587 ntTSL 57.58□□□□□ -1.28e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 514.64□□□□□ -0.075e-14■■□□□ 13
PCBP1Q15365 APOC3-203ENST00000433777 359 ntTSL 510.82□□□□□ -0.685e-14■■□□□ 13
PCBP1Q15365 BAG6-260ENST00000465348 639 ntTSL 219.3■□□□□ 0.685e-10■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-15■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)5.01□□□□□ -1.613e-15■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PIM2-202ENST00000442430 892 ntTSL 214.13□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.459e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.155e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.935e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.715e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.685e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.685e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.055e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.055e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.045e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.125e-49■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PEG10-204ENST00000493935 763 ntTSL 413.68□□□□□ -0.222e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.942e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.942e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-9■■□□□ 13
PCBP1Q15365 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.169e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.536e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.576e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.576e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.776e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 517.28■□□□□ 0.361e-11■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 528.59■■■□□ 2.173e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 325.74■■□□□ 1.713e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 516.67■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 48.47□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 57.81□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 47.09□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.7□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 DHCR7-210ENST00000533800 837 ntTSL 317.16■□□□□ 0.347e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 DHCR7-203ENST00000525137 996 ntTSL 316.94■□□□□ 0.37e-7■■□□□ 13
PCBP1Q15365 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.456e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-203ENST00000525232 1007 ntTSL 1 (best)23.29■■□□□ 1.326e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 EFNA1-204ENST00000474413 1083 ntTSL 319.89■□□□□ 0.773e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-206ENST00000528296 540 ntTSL 319.04■□□□□ 0.646e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-209ENST00000529920 876 ntTSL 218.96■□□□□ 0.636e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-204ENST00000571149 431 ntTSL 318.68■□□□□ 0.583e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-213ENST00000533397 730 ntTSL 218.26■□□□□ 0.516e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.496e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.426e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-205ENST00000571360 478 ntTSL 317.48■□□□□ 0.393e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-210ENST00000531767 570 ntTSL 517.35■□□□□ 0.376e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-212ENST00000532702 745 ntTSL 217.05■□□□□ 0.326e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-206ENST00000571870 739 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.286e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 EFNA1-203ENST00000469878 1288 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-210ENST00000573770 789 ntTSL 313.64□□□□□ -0.233e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-212ENST00000577053 731 ntTSL 513.64□□□□□ -0.233e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-211ENST00000531975 698 ntTSL 313.64□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 213.49□□□□□ -0.256e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-211ENST00000576406 795 ntTSL 313.48□□□□□ -0.253e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 SERPINF1-202ENST00000570731 459 ntTSL 512.87□□□□□ -0.353e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 212.78□□□□□ -0.366e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 EFNA1-205ENST00000497282 719 ntTSL 28.87□□□□□ -0.993e-8■■□□□ 13
PCBP1Q15365 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.786e-6■■□□□ 13
PCBP1Q15365 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-68■■□□□ 13
PCBP1Q15365 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.269e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.339e-8■■□□□ 12.9
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