Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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